余兆麒健康科學院建立了文憑-高級文憑-學士-碩士的健康科學人才培養體系，致力培養實務型人才，以解決醫療界人手短缺的問題，同時制定社區服務計劃，包括聖方濟各大學社區健康關注站、明愛聖方濟各藥房和明專獅子會糖尿病服務站，及物理治療綜合臨床教育中心，為公眾提供專業、優質的醫療服務以及提升學生的學習體驗。
學院致力於讓學生掌握前沿的知識，具備實踐能力及技能，並幫助他們樹立良好的價值觀，從而發展健康服務的事業。學院開辦了一系列與健康科學相關的課程，為學生提供全人教育，讓學生得到全面發展。
同時我們也致力於提供社區服務，為社區提供量身定做和持續的醫療保健相關服務，激發社區居民認識到自我健康維護和自我疾病管理的重要性，發揮互惠社區的精神，以達到貢獻社會，回饋國家。
學院因應不同程度學生的需求提供了不同範疇的健康科學課程，並設計了獨特的升學路徑，讓學生找到適合的切入點，從而邁入專業醫療領域。
就業前景
每年學院向社會提供逾千名專業人才，畢業生可以在公私營機構工作。合乎資格的護理學系或物理治療學系畢業生，可以分別申請成為普通科註冊護士／普通科登記護士或註冊物理治療師，其他專業的學生可以成為配藥員或健康護理工作者。
本地升學前景
修畢學士學位的畢業生可報讀本校的護理及專職醫療碩士課程，或本地其他院校的授課碩士課程，或銜接更高的研究學位，如哲學碩士／哲學博士。修畢高級文憑或文憑的畢業生，可以參考我們為學生設計的內部升學銜接途徑升讀本校課程，或申請本地或海外的升學銜接課程。
海外升學前景
學生在我校修讀高級文憑課程後可以直接兌換海外合作院校的學分，實現無縫銜接本科課程，如澳洲南澳大學藥劑學學士。無論是選擇本校或香港其他院校，還是走向國際舞臺，我校專業的課程設置與完善的升學途徑，都將為學生的學術發展奠定堅實基礎。